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HCV 基因組的早期探索
HCV 基因組的基本結構
HCV 基因組的測序工作從一開始就是一場爭分奪秒的比拼。如上所述，霍頓團隊在 1989 年論文發表前，搶先將已知的序列申請了專利；在 1989 展場設計年的論文中，他們又玖陽視覺再次強調完整的基活動佈置因組測序“即將”完成，“很快”會存放到美國國立衛生研究院啟動儀式（NIH）下屬國家包裝盒生物技術信舞臺背板息中心（NCBI）的 GenBank 數據庫中。最終，他們在 1991 年 1 月 2日提場地佈置交論文VR虛擬實境，報告了 HCV 的基因組序列。
在這一包裝設計方面，日本的研策展究則頗有捷玖陽視覺足先登之勢。由于 NCCRI 的 cDNA 克隆幾乎涵蓋了 HCV 的整個基因組，其團隊在 1990 年的論文中即已報告了相應的序列，趕在了霍頓全息投影團隊前面。而大阪大學的研究者甚至等不及獲取相對完整的 cDNA 克隆，就直接利用片段化的重疊克隆拼接出了病毒的基因組序列。經典大圖后者的研究雖然 1991 年才見刊，但實際投稿時間比NCCRI還早 11 天。競爭之激烈可見一斑。
根據上述這些研究，霍頓等于 1991 年撰寫綜述，對 HCV 基因組的結構進行了描述。大型公仔該綜述指出，HCV 含有一條長約 9 400 nt 的單股正鏈 RNA。此 RNA 的絕大部分序列是一個連續參展的可讀框（ORF）。在此 ORF 之外，病毒 RNA在5′端方向有32大圖輸出4—341 nt，包含 3—4 個小 ORF，序列高度保守；在3′端方向則是互動裝置一段非編碼序列，長度只有 27—55 nt。除此之外，霍頓團隊還報告了一條位于3′末端的多聚腺苷酸片段 poly(A)。
HCV的病毒沈浸式體驗學分類
上文提到，霍頓團隊從一開始就注意到了 HCV 與披膜病毒科和黃病毒科的親緣關系。緊接著，霍頓團隊、大阪大學和美國 NIH 下屬國家過敏和傳染病研究所（NIAID）分別開展研究，通過比對基因品牌活動組翻譯產物的氨基酸序列，進一步確認 HCV 與黃病毒科的黃病毒屬（Flavivirus）和瘟病毒屬（Pestivi道具製作rus）最為接近。1991 年，國際病毒分類委員會（ICTV）將其單列為黃病毒科下屬的第 3 個病毒屬。
HCV基因組的異質性
日本學者的工作一方面與霍頓團隊取得的結果相互印證，另一方面也揭示出不同來源的HCV基因組存在明顯的異質性。
最早注意到這種異質性的是 NCCRI 的研究者。1989 年，他們根據霍頓團隊公布的病毒核酸序列設計展場設計了多種引物，嘗試通過 RT-PCR 技術對日本患者血漿中的病毒進行擴增，結果發現只有從少數幾個序列區域衍生出的引物能夠實現成功擴增。這說明衍生自其他區域的引物與日本患者血漿中的病毒模板并不匹配。他們據此推斷日本的 HCV（HCV-J）基因組與霍頓團隊分離的 HCV（HCV-US奇藝果影像）存在差異。翌年，NCCRI 對來自不同患者的 HCV-J 進行了分析。通過對比其中長度為 275 nt 的非結構蛋白 5（NS5）編碼區，他們發現不僅 HCV-J 與 HCV-US 存在 14%—17% 的序列差異，不同的 HCV-J 之間也存在 2.5%—11% 的序列差異。這意味著 HCV 存在不同的基因型。
1991 年，日本自治醫科大學分離出了區別于 HCV-US 和 HCV-J 的第 3 種 HCV 毒株；次年，他們將當時已互動裝置有的 7 種不同毒株根據其基因組在 NS2 和包膜蛋白 1（E1）編碼區的差異分成了 4 種基因型（四分法）。然而，這種早期分類法同年即被美國 NIAID 更大規模的研究推翻。該研究在其測序FRP的 44 種 HCV 毒株奇藝果影像中發現了一些 5′端非編碼區與上述 4 種基因型存在顯著差異的毒株，這說明四分法的代表性存在問題。他們進一步分析了 51 種毒株的 E1 序列，大型公仔提出至少存在 12 種不同的 HCV 基因型 。但是，NIAID 并沒有拿出具有普適性的基因分型標準。
1993 年，沈浸式體驗英國愛丁堡大學與霍頓所供職的英國希龍公司（Chiron Corporation）合作，利用從世界各經典大圖地采集到的 76 份病毒樣本，對 HCV 的 NS5 編碼區進行了系統發育分析。根據計算結果，他們將系統進化樹中的 6 個分支列為 6 種基因型，以阿拉伯數字表示；各個基因型之下再分亞型，以小寫英文字母表示。比如，霍頓最初分離的 HCV 基因型就被命名為 1a。這種新的分型方法不僅涵蓋了AR擴增實境已知的各種基因型，還為潛在的新基因型預留了擴充的可能（第 7 種基因型發現于 2015 年），具有極強的代表性，一直沿用至今。
這些早期探索為此后更加深入的研究奠定了基礎。
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